Protein–RNA interactions for Protein: Q99MU1

Tpra1, Transmembrane protein adipocyte-associated 1, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpra1Q99MU1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tpra1Q99MU1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpra1Q99MU1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpra1Q99MU1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpra1Q99MU1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpra1Q99MU1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpra1Q99MU1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpra1Q99MU1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpra1Q99MU1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpra1Q99MU1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpra1Q99MU1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tpra1Q99MU1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpra1Q99MU1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tpra1Q99MU1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpra1Q99MU1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpra1Q99MU1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpra1Q99MU1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpra1Q99MU1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tpra1Q99MU1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpra1Q99MU1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpra1Q99MU1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpra1Q99MU1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpra1Q99MU1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpra1Q99MU1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpra1Q99MU1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tpra1Q99MU1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpra1Q99MU1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpra1Q99MU1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpra1Q99MU1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tpra1Q99MU1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpra1Q99MU1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tpra1Q99MU1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tpra1Q99MU1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpra1Q99MU1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpra1Q99MU1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Tpra1Q99MU1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tpra1Q99MU1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tpra1Q99MU1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tpra1Q99MU1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tpra1Q99MU1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tpra1Q99MU1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpra1Q99MU1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tpra1Q99MU1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tpra1Q99MU1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tpra1Q99MU1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tpra1Q99MU1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpra1Q99MU1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpra1Q99MU1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpra1Q99MU1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tpra1Q99MU1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpra1Q99MU1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpra1Q99MU1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpra1Q99MU1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpra1Q99MU1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpra1Q99MU1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpra1Q99MU1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpra1Q99MU1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpra1Q99MU1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpra1Q99MU1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpra1Q99MU1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpra1Q99MU1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpra1Q99MU1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpra1Q99MU1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpra1Q99MU1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpra1Q99MU1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpra1Q99MU1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpra1Q99MU1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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