Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP86

Snapc4, snRNA-activating protein complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc4Q8BP86 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Snapc4Q8BP86 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snapc4Q8BP86 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms