Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Knl1Q66JQ7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms