Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Prdm6Q3UZD5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Prdm6Q3UZD5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm6Q3UZD5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms