Protein–RNA interactions for Protein: P97789

Xrn1, 5'-3' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,719 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn1P97789 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Xrn1P97789 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Xrn1P97789 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Xrn1P97789 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Xrn1P97789 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Xrn1P97789 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Xrn1P97789 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Xrn1P97789 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Xrn1P97789 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Xrn1P97789 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Xrn1P97789 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Xrn1P97789 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Xrn1P97789 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Xrn1P97789 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Xrn1P97789 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Xrn1P97789 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Xrn1P97789 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Xrn1P97789 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Xrn1P97789 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Xrn1P97789 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Xrn1P97789 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Xrn1P97789 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Xrn1P97789 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Xrn1P97789 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Xrn1P97789 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Xrn1P97789 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Xrn1P97789 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Xrn1P97789 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Xrn1P97789 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Xrn1P97789 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Xrn1P97789 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Xrn1P97789 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Xrn1P97789 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Xrn1P97789 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Xrn1P97789 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Xrn1P97789 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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