Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb41P48193 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Epb41P48193 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Epb41P48193 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb41P48193 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb41P48193 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb41P48193 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41P48193 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41P48193 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epb41P48193 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms