Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Kdm5cP41230 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5cP41230 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms