Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnga1P29974 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnga1P29974 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms