Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kif3aP28741 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kif3aP28741 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms