Protein–RNA interactions for Protein: P01755

Ig heavy chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01755 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01755 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01755 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01755 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01755 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01755 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
P01755 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01755 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01755 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01755 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01755 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01755 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01755 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01755 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01755 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01755 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01755 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01755 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01755 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01755 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01755 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P01755 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01755 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01755 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01755 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01755 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01755 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01755 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01755 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01755 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01755 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01755 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01755 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01755 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01755 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01755 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P01755 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01755 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01755 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01755 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01755 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01755 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P01755 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P01755 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01755 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01755 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01755 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01755 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01755 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01755 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P01755 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01755 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01755 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01755 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01755 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01755 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01755 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01755 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01755 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
P01755 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
P01755 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01755 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01755 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01755 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01755 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01755 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01755 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01755 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01755 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01755 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01755 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01755 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01755 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01755 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01755 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01755 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01755 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01755 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01755 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01755 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01755 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01755 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01755 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01755 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01755 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01755 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01755 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01755 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01755 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01755 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01755 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01755 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01755 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P01755 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P01755 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P01755 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
P01755 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P01755 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P01755 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P01755 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms