Protein–RNA interactions for Protein: G3UVW3

Slc38a6, Probable sodium-coupled neutral amino acid transporter 6, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a6G3UVW3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a6G3UVW3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.9 ms