Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brpf1B2RRD7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms