Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms