Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp2c55Q9D816 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms