Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spns3Q9D232 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spns3Q9D232 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spns3Q9D232 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spns3Q9D232 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spns3Q9D232 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spns3Q9D232 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spns3Q9D232 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spns3Q9D232 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spns3Q9D232 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spns3Q9D232 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spns3Q9D232 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spns3Q9D232 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spns3Q9D232 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spns3Q9D232 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spns3Q9D232 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spns3Q9D232 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spns3Q9D232 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spns3Q9D232 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spns3Q9D232 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spns3Q9D232 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spns3Q9D232 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spns3Q9D232 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spns3Q9D232 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spns3Q9D232 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spns3Q9D232 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spns3Q9D232 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spns3Q9D232 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Spns3Q9D232 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spns3Q9D232 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms