Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR59

Gadd45gip1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45gip1Q9CR59 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gadd45gip1Q9CR59 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gadd45gip1Q9CR59 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms