Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1075.2 ms