Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gps1Q99LD4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms