Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lactb2Q99KR3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lactb2Q99KR3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lactb2Q99KR3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lactb2Q99KR3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms