Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc30Q8BVF4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc30Q8BVF4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc30Q8BVF4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms