Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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