Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Knl1Q66JQ7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Knl1Q66JQ7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms