Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Mdc1Q5PSV9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mdc1Q5PSV9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Mdc1Q5PSV9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mdc1Q5PSV9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mdc1Q5PSV9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Mdc1Q5PSV9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mdc1Q5PSV9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mdc1Q5PSV9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mdc1Q5PSV9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mdc1Q5PSV9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mdc1Q5PSV9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Mdc1Q5PSV9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mdc1Q5PSV9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mdc1Q5PSV9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mdc1Q5PSV9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mdc1Q5PSV9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mdc1Q5PSV9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mdc1Q5PSV9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mdc1Q5PSV9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mdc1Q5PSV9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Mdc1Q5PSV9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Mdc1Q5PSV9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mdc1Q5PSV9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mdc1Q5PSV9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mdc1Q5PSV9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mdc1Q5PSV9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mdc1Q5PSV9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mdc1Q5PSV9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms