Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam228bQ497Q6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam228bQ497Q6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam228bQ497Q6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam228bQ497Q6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam228bQ497Q6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam228bQ497Q6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam228bQ497Q6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam228bQ497Q6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam228bQ497Q6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam228bQ497Q6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam228bQ497Q6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam228bQ497Q6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam228bQ497Q6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam228bQ497Q6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam228bQ497Q6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam228bQ497Q6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam228bQ497Q6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam228bQ497Q6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam228bQ497Q6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam228bQ497Q6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam228bQ497Q6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam228bQ497Q6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam228bQ497Q6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam228bQ497Q6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam228bQ497Q6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam228bQ497Q6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam228bQ497Q6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam228bQ497Q6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam228bQ497Q6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam228bQ497Q6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam228bQ497Q6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam228bQ497Q6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam228bQ497Q6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam228bQ497Q6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam228bQ497Q6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam228bQ497Q6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms