Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TchpQ3TVW5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.3 ms