Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp444Q3TDV8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp444Q3TDV8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms