Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q08AU9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q08AU9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q08AU9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q08AU9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q08AU9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Q08AU9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q08AU9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q08AU9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q08AU9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q08AU9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q08AU9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q08AU9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q08AU9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q08AU9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q08AU9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q08AU9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q08AU9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Q08AU9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q08AU9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Q08AU9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q08AU9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q08AU9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q08AU9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q08AU9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q08AU9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q08AU9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q08AU9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q08AU9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q08AU9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q08AU9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q08AU9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q08AU9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q08AU9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q08AU9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Q08AU9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q08AU9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q08AU9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q08AU9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q08AU9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q08AU9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Q08AU9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Q08AU9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q08AU9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Q08AU9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q08AU9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q08AU9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q08AU9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q08AU9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q08AU9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q08AU9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q08AU9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q08AU9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q08AU9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q08AU9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q08AU9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q08AU9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Q08AU9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q08AU9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q08AU9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q08AU9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q08AU9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q08AU9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q08AU9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q08AU9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q08AU9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Q08AU9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q08AU9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q08AU9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q08AU9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q08AU9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q08AU9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q08AU9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Q08AU9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Q08AU9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Q08AU9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q08AU9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q08AU9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q08AU9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q08AU9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q08AU9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q08AU9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q08AU9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q08AU9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q08AU9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q08AU9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q08AU9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q08AU9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q08AU9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q08AU9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q08AU9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q08AU9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q08AU9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q08AU9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q08AU9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q08AU9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q08AU9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q08AU9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q08AU9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q08AU9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms