Protein–RNA interactions for Protein: P70323

Tbx1, T-box transcription factor TBX1, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx1P70323 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tbx1P70323 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tbx1P70323 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms