Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad7O35253 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad7O35253 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad7O35253 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad7O35253 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad7O35253 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad7O35253 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad7O35253 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Smad7O35253 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Smad7O35253 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smad7O35253 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smad7O35253 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smad7O35253 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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