Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfsd4b4J3QNS5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfsd4b4J3QNS5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfsd4b4J3QNS5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfsd4b4J3QNS5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfsd4b4J3QNS5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfsd4b4J3QNS5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfsd4b4J3QNS5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfsd4b4J3QNS5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfsd4b4J3QNS5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfsd4b4J3QNS5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfsd4b4J3QNS5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfsd4b4J3QNS5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfsd4b4J3QNS5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfsd4b4J3QNS5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfsd4b4J3QNS5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfsd4b4J3QNS5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfsd4b4J3QNS5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfsd4b4J3QNS5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mfsd4b4J3QNS5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.3 ms