Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbip1J3QMK2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms