Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700019A02RikA0A087WPV9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132 ms