Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms