Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE0

Rnf138, E3 ubiquitin-protein ligase RNF138, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138Q9CQE0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf138Q9CQE0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf138Q9CQE0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf138Q9CQE0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf138Q9CQE0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf138Q9CQE0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf138Q9CQE0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf138Q9CQE0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf138Q9CQE0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf138Q9CQE0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf138Q9CQE0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf138Q9CQE0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf138Q9CQE0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138Q9CQE0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.4 ms