Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik4Q8BMF5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik4Q8BMF5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik4Q8BMF5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik4Q8BMF5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik4Q8BMF5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik4Q8BMF5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik4Q8BMF5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik4Q8BMF5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik4Q8BMF5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik4Q8BMF5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik4Q8BMF5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik4Q8BMF5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik4Q8BMF5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik4Q8BMF5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik4Q8BMF5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik4Q8BMF5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik4Q8BMF5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik4Q8BMF5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik4Q8BMF5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik4Q8BMF5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik4Q8BMF5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik4Q8BMF5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik4Q8BMF5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik4Q8BMF5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik4Q8BMF5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik4Q8BMF5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik4Q8BMF5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik4Q8BMF5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik4Q8BMF5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik4Q8BMF5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Grik4Q8BMF5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Grik4Q8BMF5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik4Q8BMF5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms