Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJE0

Gfral, GDNF family receptor alpha-like, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GfralQ6SJE0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GfralQ6SJE0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms