Protein–RNA interactions for Protein: Q562D6

Trmo, tRNA (adenine(37)-N6)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmoQ562D6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrmoQ562D6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms