Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psme1P97371 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psme1P97371 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psme1P97371 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Psme1P97371 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psme1P97371 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psme1P97371 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Psme1P97371 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms