Protein–RNA interactions for Protein: P01657

Ig kappa chain V-III region PC 2413, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01657 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01657 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01657 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01657 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01657 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01657 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01657 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01657 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01657 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01657 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01657 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01657 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01657 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01657 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01657 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01657 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
P01657 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01657 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01657 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01657 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01657 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01657 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01657 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01657 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01657 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01657 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01657 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01657 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01657 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01657 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01657 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01657 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01657 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01657 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01657 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01657 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01657 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P01657 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01657 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01657 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01657 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01657 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01657 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01657 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01657 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01657 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01657 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01657 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01657 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01657 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01657 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01657 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01657 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01657 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P01657 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01657 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01657 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01657 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01657 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01657 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01657 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01657 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01657 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01657 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01657 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01657 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01657 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01657 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01657 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01657 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01657 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01657 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01657 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01657 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01657 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01657 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01657 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01657 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01657 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P01657 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01657 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P01657 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01657 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01657 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01657 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01657 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01657 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01657 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01657 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01657 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01657 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01657 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01657 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P01657 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01657 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01657 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01657 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01657 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01657 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01657 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms