Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad7O35253 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad7O35253 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad7O35253 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad7O35253 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad7O35253 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad7O35253 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Smad7O35253 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad7O35253 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad7O35253 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms