Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a3A2ACT7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms