Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
4933424G06RikA0A140LIP3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 742.3 ms