Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Plod3Q9R0E1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms