Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AatfQ9JKX4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AatfQ9JKX4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AatfQ9JKX4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AatfQ9JKX4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AatfQ9JKX4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AatfQ9JKX4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AatfQ9JKX4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AatfQ9JKX4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AatfQ9JKX4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AatfQ9JKX4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AatfQ9JKX4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AatfQ9JKX4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AatfQ9JKX4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AatfQ9JKX4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AatfQ9JKX4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AatfQ9JKX4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AatfQ9JKX4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AatfQ9JKX4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AatfQ9JKX4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AatfQ9JKX4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AatfQ9JKX4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AatfQ9JKX4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AatfQ9JKX4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AatfQ9JKX4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AatfQ9JKX4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AatfQ9JKX4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AatfQ9JKX4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AatfQ9JKX4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AatfQ9JKX4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AatfQ9JKX4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AatfQ9JKX4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms