Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn19Q9ET38 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms