Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cyp2c55Q9D816 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp2c55Q9D816 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms