Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vstm5Q9D806 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vstm5Q9D806 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms