Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zcchc8Q9CYA6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc8Q9CYA6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms