Protein–RNA interactions for Protein: Q99LB7

Sardh, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SardhQ99LB7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SardhQ99LB7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SardhQ99LB7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms