Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcl3Q8BVF2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms